8 800 333-39-37
Ваше имя:
Номер телефона:
Home » Misc » Ярославская порода коров характеристика

Ярославская порода коров характеристика


Ярославская порода коров

Содержимое

  • 1 Описание ярославской породы
    • 1.1 Продуктивные характеристики ярославской породы коров
  • 2 Отзывы владельцев ярославской породы коров
  • 3 Заключение

Из-за возросшего в XIX веке в обеих российских столицах спроса на молочную продукцию в Ярославской губернии начался расцвет сыроваренной и маслодельной промышленности. Успешному сбыту способствовали и удобные пути сообщения между Ярославлем, Москвой и Санкт-Петербургом. Но производство сыров и масла требует большого количества молока. В то время ярославские деревни не могли обеспечить промышленников необходимыми объемами сырья.

В попытке получить необходимое для дела молоко были созданы молочные товарищества, первоначально отбиравшие из имеющегося поголовья северных великорусских коров нужных им особей. Пока не было возможности учитывать продуктивность, отбор коров велся по масти. Быков отбирали по экстерьеру. Значительно позже ярославский скот стали отбирать по удойности и жирности молока.

В начале ХХ века ярославская порода коров получила признание промышленников и начала распространяться по соседним губерниям. После революции были созданы крестьянские племрассадники, куда владельцы коров могли приводить своих животных для случки с породистым быком, и крупные товарищества, занимавшиеся племенной работой.

В конце 30-х годов ярославок пытались скрещивать с остфризскими быками. Но такое скрещивание привело к утере главной особенности молока у ярославских коров: жирности. Качество молока резко упало. В 80-х годах ярославских коров снова скрещивали с голштинским скотом ради повышения удойности. В результате возник так называемый Михайловский тип ярославской породы.

Сегодня имеющая селекционное значение ярославка вытесняется более удойными иностранными породами, и ее численность сокращается. Общая численность коров ярославской породы в 2007 году составляла 300 тыс. голов. Это только 2,5% от общего количества КРС, разводимого в РФ. Наибольшее количество ярославского скота сосредоточено в Вологодской, Тверской, Ивановской и Ярославской областях.

Описание ярославской породы

Ярославские коровы – животные ярко выраженного молочного типа. У ярославки сухой угловатый корпус с хорошо развитым костяком. Рост коров от 125 до 127 см, косая длина от 152 до 155 см. То есть индекс растянутости у коров ярославской породы составляет 121,6 – 122. Голова сухая, изящная, легкая. Лицевая часть головы удлиненная. Шея длинная, тонкая. Грудь глубокая, но узкая, подгрудок развит слабо. Холка высокая. Крестец приподнят над поясничным отделом позвоночника, создавая нежелательную для молочной породы линию верха. Круп широкий. Ноги тонкие, короткие. Обхват пясти 17–18 см. Индекс костистости 13,6 – 14. Вымя средних размеров, чашеобразное.

Свислый или крышеобразный круп является экстерьерным недостатком.

Масть коров ярославской породы в основном черная с белой мордой. Но очень редко встречается рецессивный красный окрас. Если пежина на голове – обязательный признак ярославки, то остальные отметины желательны, но необязательны. Часто у ярославок могут быть темные «очки» вокруг глаз и пежины на брюхе, ногах и кончике хвоста.

Продуктивные характеристики ярославской породы коров

Вес взрослых ярославок небольшой: 350 – 450 кг. Быки, обладая приличной мышечной массой, могут превосходить маток по весу в 2 раза. Вес ярославского быка 700 – 900, иногда 1200 кг. На фото видно, что даже у молодого бычка при изящном костяке имеется приличное количество мышц.

Предупреждение! Быкам нельзя чесать лоб.

У крупного рогатого скота по человекоориентированности отбирались только коровы, чтобы иметь возможность получать от них молоко. Характер быков, которые шли на мясо, мало кого интересовал. Поэтому практически во всех породах КРС при спокойном нраве коров, быки часто злобны и агрессивны. Чесание лба они воспринимают как приглашение пободаться.

Телята рождаются весом 25 – 30 кг. Мясные качества ярославок хуже, чем у черно-пестрого скота, но бычки быстро откармливаются, к полутора годам достигая веса 350 кг. Убойный выход мяса с туши 1,5-летнего теленка 52 – 57%. При грамотном рационе в период откорма выход мяса может достигать 60%. Нежное нежирное мясо ярославских бычков отличается хорошим вкусом.

Молочная продуктивность за период лактации может достигать 5000 л. Молоко отличается высокими вкусовыми качествами и содержит 4% жира.

Важно! Ярославки очень отзывчивы на корма.

При улучшении рациона коровы сразу реагируют увеличением удоев. Правда, тут есть и оборотная сторона медали: при попытке скормить ярославкам низкокачественные сено или концентраты, коровы тут же «отплатят» снижением продуктивности.

Среди преимуществ породы, кроме вкусовых качеств, получаемых от скота продуктов, можно отметить устойчивость к заболеваниям, включая лейкоз.

На заметку! Покупать породистую ярославскую корову лучше в специализированных племхозяйствах.

Отзывы владельцев ярославской породы коров

Артем Казанцев, с. Мосолово

Когда выбирал себе для дома скотину, хотел маленькую коровку, чтобы поменьше места занимала. Да и хорошо бы, чтоб в еде неприхотлива была. Мне посоветовали джерсейскую. Я посмотрел цены на эту породу и решил, что обойдусь. А тут попалось объявление о продаже ярославской коровы. Оказалось, что ростом ярославская корова почти как джерсейка. Молоко только чуть менее жирное, чем у заморской скотинки. А удои могут даже и повыше быть. Пугало, что ярославка требовательна к кормам, но оказалось, что наши трава и сено эту корову вполне устраивают. Покупал нетелью. В первый отел еще ничего. Во второй стали надаивать по 2 ведра в день. Жена плешь проела про покупку сепаратора. Обещает, если не куплю, сбивать масло о мою голову. Она может.

Сергей Кистанов, пос. Поваляевы Дворы

Откровенно говоря, ярославскую породу я решил купить из-за внешнего вида, и потому что в нашем поселке такой больше ни у кого нет. Не спутаешь «случайно». Когда сравнивал характеристики ярославки с другими породами коров, было что-то лучше, что-то хуже. Кроме внешности, решающим фактором стала жирность молока. Надоела та вода, которую надаивают соседи со своих голштинских слонов. Лучше меньше, да жирнее.

Заключение

Ярославский скот хорошо подходит для содержания в приусадебных хозяйствах. Маленький размер коровы и хороший убойный выход мяса с бычка делают эту породу выгодной для частного владения. Свою требовательность к питательности кормов ярославка с лихвой оплачивает высококачественным молоком, жирность которого является одной из самых высоких.

[описание породы, фото, уход, преимущества и недостатки]

Ярославские коровы – молочные породы, распространенные на территории Российской Федерации и Украины. Периодически вид скрещивали с другими особями, так как заводчики хотели получить более продуктивных животных. В целом, они не повлияли на внешность ярославского животного. Порода относительно здоровая и не склонна болеть.

  • 1 Историческая справка
  • 2 Описание ярославской породы коров
  • 3 Показатели продуктивности
  • 4 Питание вида
  • 5 Разведение породы
  • 6 Приблизительная цена особей

Историческая справка

Вид вывели в XIX веке на территории Ярославской губернии. Животные были популярны благодаря развитию масложировой промышленности в конце прошлого века.

- Реклама -

Другие породы завозили в регион редко и в маленьких количествах, поэтому на всех желающих фермеров их не хватало. К ним относились голландская, тирольская, ангельская, симментальская, аллгауская и холмогорская породы.

Однако, вышеупомянутые виды не оказали сильного влияния на развитие ярославской коровы. Экстерьер скота молочного ярославского направления сильно отличался от заграничных братьев.

При разведении вида, заводчики придавали значение развитию молочных признаков. С другой стороны, владельцы уделяли меньше внимания внешнему виду и темпераменту. Это привело к типичным дефектам русского рогатого скота: не широкая грудная клетка, слабые мышцы на конечностях, а также неправильное положение задних ног.

- Реклама -

С 1917 года все изменилось: заводчики начали щепетильно относится к разведению и получению здоровых и крепких животных, так фермеры хотели повысить удои.

В 1924 году написали племенную книгу породы. Племенная книга – рукопись, в которую вписывают племенных животных, которые полностью соответствуют стандарту вида.

Описание ярославской породы коров

Ярославская порода коров имеет следующие характеристики. Тело животного удлиненное, кости тонкие, ноги короткие. На корпусе преобладают черные оттенки. Также там присутствуют белые пятнышки. Голова животных окрашена в белый и черные цвета.

Ярославская корова достигает 125-127 см в росте. Это животное с хорошо развитым телом, длина которого составляет 152-155 см. При рождении, телята весят от 28 до 32 кг. Взрослые коровы весят окло 460-500 кг, а взрослые быки – 700-800 кг.

- Реклама -

С приходом молочной промышленности, животных начали отбирать для получения молока, которое подходит для приготовления сыра. Из пастеризованного молока готовят два вида местных сыров: Угличский и Ярославский.

Российские эксперты утверждают, что ярославская порода – чисто русская. Она разработана без чужих кровных родов, путем традиционного отбора.

Сегодня, большинство поголовья чистопородного ярославского скота выращивается двумя компаниями, причем скот происходит из восьми семей. Последняя информация о количестве вида относится к 2007 году. В то время, в России жило около 300 тысяч животных.

В описании ярославской породы коров отмечается, что в настоящее время спрос на животное находится в упадке. Это связано с появлением фризского вида, который скрещивают с ярославскими быками. Также присутствует ряд неблагоприятных экономических условий, которые препятствуют развитию молочных пород скота в Российской Федерации.

Показатели продуктивности

Ниже приведено сравнение ярославской породы коровпо показателям продуктивности с другими известными молочными видами.

Название вида % жира % белка Среднегодовая выработка молока, тонн Возможность выращивания в России и Украине
Айширская 4,20 3,40 8,50 +
Голландская 3,50-4,00 3,00-3,50 4,50 —
Голштинская
красная 3,90 3,40-3,70 4,10 +
черно-белая 3,80 3,40-3,70 4,10 +
Джерсейская 5,0-6,0 4,00 3,00-3,50 —
Красная степная 3,50-4,00 3,70-3,90 3,20-3,50 +
Холмогорская 3,60-3,70 3,30-3,40 3,50-4,00 +
Чёрно-пёстрая 3,70-3,90 3,20 5,00 +
Ярославская 4,40-4,50 3,40-3,70 2,70-3,50 +

Как видно из таблицы, ярославская порода коров имеет средние показатели по содержанию жира и белка. Однако, среднегодовая выработка животного не дотягивает до лидеров.

Также, согласно таблице, молоко вида содержит 4,40-4,50% жира и 3,40-3,70% белка. Поэтому молоко животных подходит как для питья, так и для приготовления молочных продуктов: сыра, творога, масла. Для сравнения: у гольшинского вида содержание жира составляет 3,90%, а белка – до 3,70%. При этом у них высокая продуктивность.

Период лактации коров составляет 305-310 дней в году.

Телка ярославской породы используется исключительно для получения молока, а вот бычков откармливают для получения мяса. Полезный выход – 50-58% от массы животного. Забивать быка можно по достижении 18 месяцев, в это время мальчик достигает максимума роста. Откармливать животных до 29-30 месяцев не рекомендуют. Вы затратите больше средств на кормление быков, чем получите прибыли от продажи их мяса.

Отмечается, что бык будет набирать вес лучше после кастрации. Также это повышает качество мяса.

Питание вида

Ярославская молочная порода коров, фото которой представлено ниже, хорошо адаптируется к новой пище и условиям жизни.

Вид питается травой. В летнее время животные предпочитают одуванчики и другие сочные растения.

Дополнительно давайте животным костную или рыбную муку. Продукты помогут сохранить необходимое количество минералов в организме животного. Это также важно во время беременности телочки, так как формируется скелет у теленка.

Заранее заготовьте сено, силос и корнеплоды для зимнего периода. Животные также любят буряк.

Периодически давайте виду концентрированные корма: комбикорм, макуху, жмых, отруби. Эти продукты содержат белковые вещества в повышенных количествах.

Обратите внимание на питание животного мужского пола. Характеристика питания быка влияет на наращивание мышечной массы. Следите за тем, чтобы бык ярославской породы получал пищу в сбалансированном количестве: для них неприемлемо как недоедание, так и переедание. Вносите в диету мальчиков жмых или добавки, которые содержат много протеина. 100-120 грамм в день будет достаточно.

h4 – Уход за животным

Уход и содержание за ярославской молочной породой коров – не сложная задача. Поэтому российские фермеры часто выращивают именно этот вид. Главное достоинство породы – низкая предрасположенность как к легким, так и к тяжелым болезням.

Основные правила по уходу за животным:

  • Дезинфицируйте стойла животных перед зимним периодом.
  • Предотвратите сквозняки в холодные месяцы.
  • Окна в помещении располагайте выше роста животных.
  • Проводите плавную подготовку смены зимнего периода на летний.
  • Периодически мойте коров, а также подрезайте копыта.
  • Приглашайте ветеринара для осмотра. Это поможет избежать сложностей со здоровьем.

Разведение породы

Это неприхотливый вид. Поэтому, ярославскую породу будет не сложно разводить. Животное прекрасно себя чувствует, как в полях и степях, так и в лесу. Также корове не нужны специальные условия содержания в помещении. Мягкая кровать из стога сена – то, что нужно для комфортного сна.

Важно позаботится о новорожденных телятах, а также о беременных телочках. Старайтесь оградить будущую маму от остального стада. Если беременность происходит в холодные месяцы, возможно потребуется оборудовать дополнительное тепло в помещении. Главное – не допускайте резкой перемены температуры.

Девочка достигает половой зрелости в 18 месяцев, а первую случку организовывают в 20 месяцев. Делать вязку рекомендуют каждый год в одно время.

Роды не требуют вмешательства человека. За один раз рождается 5-6 малышей.

Приблизительная цена особей

Ярославская порода коров не является распространенной. Поэтому купить животных не такая простая задача. Чтобы приобрести вид, обратитесь в сельские хозяйства Ярославского, Тверского или Вологодского регионов. Там собственно и разводят животных.

Для взрослой коровы ярославской породы цена будет достигать 1300-1600$, что составляет 35000-45000 грн. Стоимость молодой телочки составит 240-340$, что равняется 6000-9000 грн. Относительно дорого обойдется бык. Стоимость мальчика составит до 2500$ (~70000 грн).

Ресеквенирование геномов ярославского крупного рогатого скота выявило сигнатуры селекции и редкий гаплотип на BTA28, который, вероятно, связан с фенотипами породы

  • Список журналов
  • Wiley-Blackwell Online Open
  • PMC9541747

Генетика животных

Аним Жене. 2022 окт.; 53(5): 680–684.

Опубликовано в сети 16 июня 2022 г. doi: 10.1111/age.13230

, 1 , 2 , 1 , 1 , 3 и 1 , 2 , 4

Информация об авторе Примечания к статье Информация об авторских правах и лицензиях Отказ от ответственности

Дополнительные материалы
Заявление о доступности данных

Геномы местного скота могут пролить свет на их генетическую историю, механизмы адаптации к окружающей среде и уникальные генетические особенности. Здесь мы изучаем генетику и адаптации русской аборигенной молочной ярославской породы крупного рогатого скота, используя 22 повторно секвенированных особи и сравнивая их с двумя родственными породами (российской холмогорской и голштинской), а также с тауриновым набором проекта «1000 геномов быков» (выполнение 9).). Анализ HapFLK холмогорской и голштинской пород (с использованием якутского крупного рогатого скота в качестве внешней группы) привел к выделению 22 областей селекции ( q -значение < 0,01) на 11 хромосомах, отнесенных к ярославскому скоту, включая сильный признак селекции в области KIT. ген на BTA6. Ф ST (индекс фиксации) с набором данных 1000 Bull Genomes показал 48 непересекающихся вершин (0,1%) F ST области, из которых три перекрываются области HapFLK. Мы определили 1982 высокодифференцированные ( F ST  > 0,40) миссенс-мутаций в ярославских геномах. Эти гены были обогащены эпидермальным фактором роста и функциональными категориями, связывающими кальций. Топ F Интервалы ST содержали восемь генов с сильно различающимися частотами аллелей между ярославской и холмогорской породами и остальной частью набора данных 1000 Bull Genomes Dataset, включая KAT6B , который имел вредоносную миссенс-мутацию, характерную почти для ярославской породы, с самым высоким Ф ST в нашем наборе данных (0,99). Этот ген является частью длинного гаплотипа, содержащего другие гены из F . Анализы ST и hapFLK и с отрицательной ассоциацией с массой и признаками туши по данным генотипирования 30 фенотипированных особей ярославского крупного рогатого скота. Наша работа предоставляет отрасли генетические варианты-кандидаты, на которых следует сосредоточить усилия по улучшению породы.

Ключевые слова: 1000 Проект геномов быков, Ф СТ , hapFLK, KAT6B , сигнатуры селекции, Ярославский крупный рогатый скот

Обитая в суровых климатических условиях, российские породы крупного рогатого скота должны были выработать адаптации, которые теперь можно проследить в участках генома при отборе и конвергентно эволюционирующих генах (Buggiotti et al. , 2021 ). Одной из видных молочных пород крупного рогатого скота, сформировавшихся в европейской части России с XVII века, является ярославский скот. Эта порода произошла от северного великорусского скота, который был небольшого роста и низкой продуктивности, но мог выжить в суровых условиях с плохими кормовыми возможностями (Лискун, 9).0017 1949 ). Полученная ярославская порода адаптивна, кормоэффективна и сохраняет хорошую воспроизводительную способность даже при низких температурах при недостатке кормов, что сделало ее особенно популярной среди крестьян (Лискун, 1919 ). Ярославская порода черная, с белым животом, ногами, хвостом и головой, с черными отметинами, напоминающими «очки». Целью данного исследования было выявление признаков отбора и генетических вариантов, вносящих вклад в фенотипы и адаптации ярославского скота. Изучение таких пород, как ярославская, важно для целей сохранения, устойчивого и эффективного разведения, а также для генетического улучшения адаптированного к местным условиям скота.

Для исследования были отобраны 22 особи ярославского крупного рогатого скота. Образцы были повторно секвенированы с использованием технологии Illumina Hiseq4000 в Novogene (HK) Co. Ltd (Китай) до ~ 50 Гбит каждый. Очищенные чтения были сопоставлены с эталонной сборкой генома крупного рогатого скота (bosTau9) с использованием BWA-MEM и обработаны с использованием конвейера проекта 1000 Bull Genomes Project (gatk v. 3.8; https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us). Файлы GVCF были отправлены в проект 1000 Bull Genomes Project и включены в прогон 9. После контроля качества (QC) и сокращения неравновесного сцепления мы рассчитали парную меру PI_HAT (доля IBD, то есть P (IBD = 2) + 0,5* P (IBD = 1)) родства с использованием программного обеспечения plink (−genome) (таблица S1).

Из 22 особей ярославского крупного рогатого скота 10 наиболее чистых животных на основании их структуры и результатов анализа главных компонентов (Юрченко и др., 2018 ) были отобраны для сигнатур селекционного сканирования с помощью hapFLK (Fariello et al. , 2013 ). Эти образцы были сопоставлены с bosTau6 в соответствии с протоколом, описанным Buggiotti et al. ( 2021 ) и объединены с ранее существовавшими файлами GVCF холмогорской (20), якутской (20) и голштинской (20) пород (Buggiotti et al., 9).0017 2021 ), чтобы получить совместный файл vcf (описания пород см. в Приложении S1). Вызов вариантов был выполнен в соответствии с набором инструментов для анализа генома (gatk; Van der Auwera et al., 2020 ). Фильтрация однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) по качеству («жесткая фильтрация») применялась с использованием следующих параметров: (i) достоверность/качество варианта по глубине < 2; (ii) качество картирования RMS (MQ) < 40,0; (iii) Phred-шкала p - значение с использованием точного критерия Фишера для обнаружения смещения цепи  > 60; (4) Z - оценка по критерию суммы рангов Уилкоксона для альтернативных MQ по сравнению с эталонным чтением (MQRankSum) <-12,5; и (v) Z - оценка по критерию суммы рангов Уилкоксона для альтернативного смещения позиции чтения по сравнению с эталонным (ReadPosRankSum) <-8. Пороговые значения для этих параметров были взяты из рекомендаций gatk Best Practices (Van der Auwera et al., 2020 ). Варианты Indel были удалены. Мультиаллельные SNP были преобразованы в биаллельный формат с использованием bcftools с параметрами norm -m . Полученный файл VCF был преобразован в формат plink, удалив людей с частотой вызовов <0,09.и маркеры с недостатком > 0,01 или частотой минорного аллеля (MAF) <0,1 для сигнатур сканирования селекции с hapFLK (-K 30 -nfit = 30) с образцами якутского крупного рогатого скота в качестве внешней группы. Значения p ‐ были рассчитаны с использованием сценария scaling_chi2_hapflk.py (Fariello et al., 2013 ). Значения Q были рассчитаны с использованием R-функции «qvalue» (Storey & Tibshirani, 2003 ). Взвешенный F СТ (индекс фиксации) рассчитана статистика на 22 особи ярославского КРС против 4 779животные (охват >6×) тауринового крупного рогатого скота из проекта 1000 Bull Genomes Project (запуск 9) с использованием vcftools v. 0.1.13 с параметрами --fst-window-size 50 000 --fst-window-step 25 000 --- max-missing 0,9 и для отдельных SNP без опций --fst-window-size, -fst-window-step. Перевод координат генома крупного рогатого скота между сборками UMD3.1 и ARS/UCD1.2 был выполнен с использованием инструмента UCSC Genome Browser liftover с параметрами по умолчанию. Верхние 0,1% F СТ окна сравнивали с интервалами hapFLK. Направление отбора определяли с помощью локальных филогенетических деревьев и кластеризации гаплотипов по интервалам hapFLK без F Интервал ST перекрывается. SNP-кандидаты были аннотированы с помощью пайплайна NGS-SNP (Grant et al., 2011 ; bosTau6) и snpeff (Cingolani et al., 2012 ; bosTau9). Миссенс-варианты в составе генов MSS51 и KAT6B амплифицировали с использованием ПЦР на 30 фенотипированных особях ярославского крупного рогатого скота (Приложение S2). Продукты ПЦР разрезали рестриктазами HinfI и HpySE526 I (ООО «СибЭнзим») в течение MSS51 и KAT6B соответственно. Связь между фенотипами, полученными из учетных карт отдельных самок, и генотипами (таблица S2) оценивалась с использованием однофакторного дисперсионного анализа (функция «aov» R) и линейной регрессии (функция «lm» R).

Всего в наборе четырех пород (ярославская, холмогорская, голштинская и якутская) выявлено 27 391 619 SNP, из которых 6 069 156 были использованы в анализе hapFLK. В результате было отобрано 22 региона ( q -значение <0,01) на 11 хромосомах, присвоенных ярославскому крупному рогатому скоту (рисунок; таблица S3). Сравнение жителей Ярославля с набором данных 1000 геномов быков привело к 48 непересекающимся регионам с верхними 0,1% из Ф значения ST (рисунок S1; таблица S4). Четыре интервала перекрывались между hapFLK и F . Результаты ST , один из которых (BTA29: 27 527 228-27 711 900) содержал один ген TMEM225 с одной миссенс-мутацией (Phe73Leu), показывающей F Значение ST  0,76 при сравнении ярославского крупного рогатого скота с набором данных 1000 Bull Genome Dataset. Трансмембранный белок 225B ранее был связан с гиперактивностью сперматозоидов у свиней (van Son et al., 2020 ) и, следовательно, может способствовать развитию признаков фертильности. HapFLK выявил сильный признак отбора на BTA6: 71 464 554-71 892 219, содержащий KIT , который, как известно, является геном «пятнистости» у крупного рогатого скота (Fontanesi et al., 2010 ). Мы не выявили каких-либо миссенс-мутаций с высоким уровнем F . ST в этой области, предполагая, что отбор действовал на гаплотипы и регуляторные последовательности. Восемь дополнительных генов были обнаружены в промежутках с верхними 9 генами.0047 Ф значения ST и имели миссенс-мутации с производными частотами аллелей, сильно отличающимися между ярославским скотом, холмогорским скотом и остальной частью набора данных геномов таурина 1000 быков. Эти гены включали RHBDL2 , FCHO1 , LPIN1 , TTC28 , SNX25 , KAT6B , VRK2 и ZnF23998. . Из них SNX25 содержал пять миссенс-мутаций с высоким F СТ ( Ф ST диапазон 0,53–0,56) и TTC28 содержал четыре ( F ST диапазон 0,95–0,97). SNX25 является ключевым геном в регуляции передачи сигналов TGF-β и, следовательно, способствует иммунной системе (Nishimura et al., 2021 ), тогда как TTC28 важен для сборки веретена в митозе и мейозе (Chen et al. др., 2018 ). Высшая миссенс-мутация F Значение ST наблюдалось для варианта KAT6B, Val105Met ( Ф ST  = 0,993), самый высокий среди всех миссенс-вариантов ярославского скота, что позволяет предположить, что этот вариант почти специфичен для ярославского скота. Действительно, среди 5 074 оставшихся животных из тауринового набора Проекта 1000 геномов быков, успешно генотипированных по этому локусу, такая же мутация была обнаружена только в гетерозиготном состоянии у двух особей современного рыболова и двух особей литовской красной, в то время как частота производного аллеля А в ресеквенированном ярославском поголовье крупного рогатого скота составила 0,64. Область размером 50 КБ с высоким значением Ф СТ  (0,36) у ярославского крупного рогатого скота также содержал КАТ6В . Этот интервал находился на расстоянии 574 т.п.н. от сильного признака отбора, идентифицированного с помощью hapFLK и содержащего гены VCL и AP3M1 . Между ними еще регион 200 кбит с F ST  = 0,53 содержал ADP . Дополнительная миссенс-мутация с высоким уровнем F ST (0,986) располагался перед VCL в МСС51 . ПЦР-генотипирование и анализ ассоциации мутаций MSS51 и KAT6B с использованием 30 особей ярославского крупного рогатого скота выявили полное сцепление производных аллелей и отрицательную связь гаплотипа с признаками веса и туши (таблица S5 и рисунок S2). Когда была изучена структура гаплотипов региона между MSS51 и KAT6B , она действительно показала наличие длинного гаплотипа, присутствующего только у ярославских особей (рисунок ). Ф Данные ST и hapFLK позволяют предположить множественные сигнатуры селекции в этой области или, альтернативно, наличие некоторых мутаций в выбранном гаплотипе. Анализ NGS-SNP миссенс-вариантов MSS51 и KAT6B предполагает пагубное влияние замены KAT6B (сортировка непереносимых от толерантных, SIFT = 0,01; таблица S6) и высокую эволюционную консервативность аминокислоты эталонного генома, которая была обнаружен в этом положении у большинства млекопитающих, проверенных в базе данных гомологии белков NCBI (таблица S6). Наблюдаемое изменение обнаружено в высококонсервативном домене гистона h25, что дополнительно подтверждает его функциональный эффект. Гены в этом гаплотипе имеют функции, относящиеся к экономически важным признакам, объясняющим возможности для одиночных или множественных независимых сигналов отбора. MSS51 — белок, специфичный для скелетных мышц, участвующий в определении типа волокон и их метаболизме (Moyer & Wagner, 9).0017 2015 ). ADK ранее был обнаружен при селекции у симментальского крупного рогатого скота и был связан с физиологическим состоянием животных (Ramey et al., 2013 ). VCL представляет собой белок цитоскелета, участвующий в закреплении F-актина на мембранах. Дефекты VCL приводят к дилатационной кардиомиопатии (Wells et al., 2011 ), сходной с NRAP, недавно обнаруженной конвергентной эволюцией у адаптированного к холоду якутского крупного рогатого скота, а также у впадающих в спячку и адаптированных к холоду видов (Buggiotti et al., 2021 ). KAT6B ранее ассоциировался с признаками туши, включая морфологию конечностей крупного рогатого скота (van den Berg et al., 2014 ). Наши данные и результаты ассоциативного анализа позволяют предположить, что ярославский гаплотип отвечает за меньшую массу и рост, что исторически могло быть полезным в суровых экологических условиях и низкой кормовой базе в России. Отсутствие этого гаплотипа у большинства других пород крупного рогатого скота предполагает его негативное влияние в других условиях окружающей среды и/или негативный отбор человеком. Это означает, что породы, которые все еще имеют производные аллели с низкой частотой (например, удильщик и литовская красная), потенциально могут выиграть от дальнейшего устранения этого гаплотипа.

Открыть в отдельном окне

Результаты анализа HapFLK ярославской, холмогорской и голштинской пород. Зеленым отмечены районы селекции ярославского скотоводства. Синяя линия показывает значимость при q -значение = 0,05, а красная линия показывает q -значение = 0,01. Красным показаны области, перекрывающиеся между hapFLK и F . Анализы ST . Отобранный регион, перекрывающий ген KIT , показан с гаплотипическим разнообразием для голштинского (HOL), холмогорского (KHO) и ярославского (YAR) крупного рогатого скота. Положения миссенс-мутаций показаны для KAT6B и TMEM25 генов с количеством гомозиготных по обоим аллелям и гетерозиготных особей, указанных ниже частоты чатов. Зеленый цвет указывает на референсный аллель, а красный — на производный аллель. (а) генный трек из ансамбля. (б) Гаплотипы голштинской, холмогорской и ярославской пород с ярославским гаплотипом, показанным фиолетовым цветом. Выбранный интервал hapFLK, содержащий генов VCL и AP3M1 затенены синим цветом. Зеленым цветом затенены два интервала с максимумом F Значения ST . (c) Ярославский крупный рогатый скот на основе SNP F Анализ ST с набором данных 1000 Bull Genomes Project Dataset с указанием положения миссенс-мутации MSS51 зеленым цветом и миссенс-мутации KAT6B красным >0,1) с SNP Ф Значения ST >0,4 по сравнению с остальными тауриновыми животными из проекта 1000 Bull Genomes (таблица S6). Эти SNP были обнаружены в 1483 генах. Функциональный кластерный анализ Дэвида (таблица S7) выявил 16 кластеров (показатель обогащения  > 1,3), из которых верхний кластер (показатель обогащения = 4,87) содержал функциональные категории эпидермального фактора роста (ложная частота обнаружения, FDR = 0,0004), эпидермальных домен, подобный фактору роста (FDR = 0,0004), EGF-подобный кальций-связывающий (FDR = 0,001) и т. д. Эпидермальный фактор роста играет важную роль в развитии молочной железы и регенерации эпителия и способствует врожденным иммунным ответам (Fu et al., 2015 ; Gabadage et al. ., 2017 ), предполагая, что гены из этого кластера могут способствовать признакам молочной продуктивности. Другой функциональный кластер (оценка обогащения = 1,87) содержал несколько терминов, связанных с кератином , что позволяет предположить, что гены кератина эволюционировали у ярославского крупного рогатого скота, вероятно, обеспечивая дополнительную защиту животных во время долгих и холодных зим России.

Наша работа представляет собой первую полногеномную оценку геномов российского ярославского крупного рогатого скота на уровне нуклеотидов в контексте пород со всего мира и указывает на сигнатуры селекции и конкретные генетические варианты, которые могут способствовать адаптации и фенотипам для дальнейшего улучшения породы. .

Приложение S1

Щелкните здесь, чтобы просмотреть файл с дополнительными данными. (588K, документ)

Приложение S2

Щелкните здесь, чтобы просмотреть файл с дополнительными данными. (13K, док)

Рисунок S1

Рисунок S2

Щелкните здесь, чтобы просмотреть файл с дополнительными данными. (1002K, pdf)

Таблица S1

Таблица S2

Таблица S3

Таблица S4

Таблица S5

Таблица S6

Таблица S7

Щелкните здесь, чтобы просмотреть файл с дополнительными данными. (1.1M, xlsx)

Работа выполнена при финансовой поддержке Курчатовского центра геномики IC&G (075-15-2019-1662). Авторы благодарят участников проекта 1000 Bull Genomes Project за предоставление данных о последовательности и запуск конвейера обнаружения SNP.

Рувинский, Д. , Игошин, А. , Юрченко, А. , Ильина, А.В. & Ларкин, Д.М. (2022) Повторное секвенирование геномов ярославского крупного рогатого скота выявило признаки селекции и редкий гаплотип на BTA28, который, вероятно, связан с фенотипами породы. Генетика животных, 53, 680–684. Доступно с: 10.1111/возраст.13230 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Двадцать два ресеквенированных генома ярославского крупного рогатого скота были представлены в NCBI SRA и доступны под регистрационным номером PRJNA814817.

  • Буджотти, Л. , Юрченко, А.А. , Юдин, Н.С. , Вандер Джагт, С.Дж. , Воробьева, Н.В. , Куслий, М.А. и другие. (2021) Демографическая история, адаптация и конвергентная эволюция NRAP по аминокислотному остатку 100 у самого северного в мире крупного рогатого скота из Сибири. Молекулярная биология и эволюция, 38, 3093–3110. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Chen J, Castelvecchi G, Li-Villarreal N, Raught B, Krezel A, McNeill H et al. 2018. Атипичный кадгерин Dachsous1b взаимодействует с Ttc28 и Aurora B, чтобы контролировать динамику микротрубочек при расщеплении эмбрионов. Ячейка развития 45:e375, 376–391. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Чинголани, П. , Платтс, А. , Ван Ле, Л. , Кун, М. , Нгуен, Т. , Ван, Л. и другие. (2012) Программа аннотирования и прогнозирования эффектов однонуклеотидных полиморфизмов, SnpEff: SNP в геноме Drosophila melanogaster штамма w1118; изо-2; изо-3. Флай (Остин), 6, 80–92. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Фариелло, М.И. , Бойтар, С. , Ная, Х. , Сан-Кристобаль, М. & Сервин, Б. (2013) Обнаружение признаков отбора посредством дифференциации гаплотипов среди иерархически структурированных популяций. Генетика, 193, 929–941. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Фонтанези, Л. , Таццоли, М. , Руссо, В. & Бивер, Дж. (2010) Генетическая гетерогенность гена KIT крупного рогатого скота у пород крупного рогатого скота, несущих различные предполагаемые аллели в локусе пятнистости. Генетика животных, 41, 295–303. [PubMed] [Академия Google]
  • Фу, Нью-Йорк , Риос, А.С. , Пал, Б. , Соэтанто, Р. , Лун, А.Т. , Лю, К. и другие. (2015) ЭФР-опосредованная индукция Mcl-1 при переходе на лактацию необходима для выживания альвеолярных клеток. Nature Cell Biology, 17, 365–375. [PubMed] [Академия Google]
  • Габадаге, К. , Чирино-Трехо, М. , Кэмпбелл, Дж. & Луби, С. (2017)Эффективность рекомбинантного бычьего эпидермального фактора роста при лечении экспериментального субклинического мастита Staphylococcus aureus на модели овцы. Открытая ветеринарная запись, 4, e000179. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Грант, Дж.Р. , Арантес, А.С. , Ляо, X. & Стотхард, П. (2011) Углубленная аннотация SNP, возникающих в результате изменения последовательности проектов с использованием NGS-SNP. Биоинформатика, 27, 2300–2301. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Лискун, Е.Ф. (1949) Домашние породы крупного рогатого скота. Москва: Государственное издательство аграрной литературы Жданова «Кр Пролетарий», стр. 55–64. [Академия Google]
  • Лискун, Е.Ф. (1919) Чем хорош русский северный скот. Петроград: Изд-во Наркомзема, с. 23. [Google Академия]
  • Мойер, А.Л. & Вагнер, К.Р. (2015) Mammalian Mss51 представляет собой специфичный для скелетных мышц ген, модулирующий клеточный метаболизм. Журнал нервно-мышечных заболеваний, 2, 371–385. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Нисимура, К. , Танака, Т. , Такемура, С. , Тацуми, К. & Ванака, А. (2021) SNX25 регулирует экспрессию провоспалительных цитокинов через сигнал NF-kB в макрофагах. PLoS One, 16, e0247840. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Рэми, Х.Р. , Декер, Дж.Э. , Маккей, С.Д. , Рольф, М.М. , Шнабель, Р.Д. & Тейлор, Дж.Ф. (2013) Обнаружение селективных зачисток у крупного рогатого скота с использованием полногеномных данных SNP. BMC Genomics, 14, 382. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Стори, Дж.Д. & Тибширани, Р. (2003) Статистическая значимость для полногеномных исследований. Труды Национальной академии наук, 100, 9440–9445. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Ван ден Берг, И. , Фриц, С. , Родригес, С. , Роча, Д. , Буссаа, М. , Лунд, М.С. и другие. (2014)Анализ соответствия для обнаружения QTL у молочного скота: тематическое исследование морфологии ног. Genetics, Selection, Evolution, 46, 31. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Ван дер Авера, Г. , О’Коннор, Б. & Сафари, АОРМК. (2020) Геномика в облаке. Ньютон, Массачусетс: O'Reilly Media Incorporated. [Академия Google]
  • Ван Сон, М. , Тремоэн, Н.Х. , Гаустад, А.Х. , Воге, Д.И. , Зеремайкл, Т.Т. , Миромслин, Ф.Д. и другие. (2020) Профилирование транскриптома ткани семенников свиньи выявило гены, связанные с гиперактивной подвижностью сперматозоидов. BMC Veterinary Research, 16, 161. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Уэллс, К.С. , Осборн, Н.Л. , Функе, Б.Х. , Пфотенхауэр, Дж.П. , Фреди, Дж.Л. , Бакстер, С. и другие. (2011)Семейная дилатационная кардиомиопатия, связанная с врожденными дефектами в условиях новой мутации VCL (Lys815Arg) в сочетании с известным вариантом MYPBC3. Кардиогенетика, 1, 45–48. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
  • Юрченко, А.А. , Дэтвайлер, Х.Д. , Юдин, Н. , Шнабель, Р.Д. , Вандер Джагт, С.Дж. , Солошенко, В. и другие. (2018) Сканирование сигнатур селекции в геномах российских пород крупного рогатого скота выявило новые гены-кандидаты на адаптацию к окружающей среде и акклиматизацию. Scientific Reports, 8, 12984. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

Современные племенные ресурсы ярославской породы крупного рогатого скота

УДК 636.271.082.2(470)

DOI 10.33943/MMS.2019.7.42231

 

ФУРАЕВА Н.С. . 1,2 , ЗВЕРЕВА Е.А. 1,2 , VOROBYOVA S.S. 1

1  JSC «Yaroslavl» of breeding

2  Yaroslavl state agricultural Academy

 

The В статье представлено современное состояние племенной базы ярославской породы крупного рогатого скота в России. На сегодняшний день имеется достаточное количество генетических ресурсов маточного и крупного рогатого скота, позволяющих улучшать породу при чистопородном (без кровопролития родственных пород) разведении. Племенную базу ярославской породы составляют 11 племенных заводов и 22 племенных производителя. было 429Подконтрольного поголовья крупного рогатого скота ярославской породы на 01.01.2019 в России 48 голов, в том числе 26493 коровы. Удой коров в племзаводе составил 6256 кг молока жирностью 4,24%, содержанием белка 3,24%. Выход телят составляет 89%. Средний возраст выхода на пенсию составляет 3,7 года отела. В российских племзаводах, занимающихся разведением ярославской породы, содержалось 39 быков-производителей ярославской породы, в том числе 17 животных — чистопородных ярославских 8 линий. Общий запас семян составил 1069 шт.,3 тыс. доз, в том числе чистопородным быкам без кровопролития других пород — 665,2 тыс. доз. В статье определены направления и методы перспективной работы с породой для ее качественного улучшения и сохранения уникального отечественного генофонда в современных экономических условиях.

Ключевые слова: Ярославская порода, племенные хозяйства, молочная продуктивность, продуктивность показатели, долголетие, учет коров, быки-лидеры породы.

 

ЛИТЕРАТУРА

  1. Моноенков М.И. Ярославскаяпородаскота [Текст] / М.И. Моноенков. — Ярославль, 1974. — 280 с. 2. Гладыр Е.А. Диагностика полиморфизма генов альфа-лактальбумина крупного рогатого скота [Текст] / Е.А. Гладыр, О.В. Костюнина, Н.А. Зиновьева // Современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных. — Дубровицы. — 2002. — С. 109—110. 3. Максименко В.Ф. Система управления селекционным процессом и генетическим потенциалом в стадах ярославского скота [Текст] / В.Ф. Максименко, Н.М. Косяченко, Н.С. Фураева, М.В. Абрамова, Н.А. Тарасенкова, Н.И. Красавина // ФГБНУ ЯРНИИЖК, 2005. — 131 с. 4. Некрасов Д.К. Взаимосвязь полиморфных вариантов генов пролактина, гормона роста и каппа-казеина с молочной продуктивностью коров ярославской породы [Текст] / Д.

    Learn more